黑臭水体治理的理念是大势所趋，但由于我国大部分河道治理公司初涉其中，经验不足，容易出现很多误区。

1.污染源治理与生态治理不同步

大部分河道水质恶化的主要原因是沿线点源和面源的排入。河道生态治理设计时，有些设计往往只关注生态措施的应用，而对引起水质恶化的源头未采取措施，污染源治理与生态治理不同步，治标而不治本，采用再多的治理措施也达不到好的效果，水质仍会继续下降，水生动植物难以存活，生态系统无法在此环境下构建成功，强化净化措施的作用有限且费用较高，无法体现河道生态治理的精神和目标。

因此，在设计时应分析河道的主要污染来源，并对主要污染源采取截流纳管、就地处理、沟渠净化、湿地净化等措施，有效降低入河污染物量后再开展生态治理，这样才能事半功倍。

2.不重视河道的流通问题

“流水不腐”体现了流动水体的净化能力及水质维持能力。但是，有些设计不重视河道的流通问题，对断头浜或者不流通的水体，根据现场情况采取生态护岸、植物构建、强化净化等生态措施，以期达到水质改善的目标。这些措施可能会达到预期的效果，但其稳定性不能保证，且运行维护管理工作量较大，运行费用高。

故设计时应积极探寻水体流动的方案，如水系沟通，利用涵管、新开挖沟渠等连通水系;水体循环，采用循环泵、搅拌机等改善水体流态，将水体循环流动起来;合理调度，利用外河水位差使水体流动，充分利用流水的自净能力及水质维持能力改善水质。

3.过度强调陆域景观设计

陆域景观能充分展现河道的治理效果，给人们留下美好的印象，而水生态系统位于水下，肉眼难以判别其水生态系统的完整和好坏，也无法判定水质改善程度。所以，有些设计过度强调陆域景观设计，将生态治理的资金大部分用于陆域景观的建设，将陆域绿化带设计的主题鲜明，美仑美奂，而忽视水下生态的构建，本末倒置，偏离了河道生态治理的总目标。